代理记账公司会计凭证是记录代理记账服务的依据，应当注明凭证的由来、发生日期、科目体系、科目编号及其他相关资料，其编制是审计人员进行记录证明、核查财务会计报表及审计过程的重要依据。代理记账凭证是配合会计报表代理记账凭证的编制，在代理记账服务中扮演重要角色，是审计进行记录证明、核查财务会计报表的重要依据，也是被审计单位的政府税务机关审计的重要依据。因此，代理记账凭证必须完整、真实、准确。
在处理代理记账凭证时，有几个步骤需要注意：
审批准确无误：在对初始凭证审批没有问题的基础上填制记账凭证。这是内部结构制约制度的一个关键步骤。
内容详细：记账凭证应当包含的内容都要具有。应当特别注意的是：以自制的初始凭证或者初始凭证汇总表替代记账凭证应用的，也要具有记账凭证所应当的内容。
归类正确：根据经济工作的内容，正确区别不同类型的初始凭证，正确运用会计学科。
持续序号：记账凭证应当持续序号。这有助于判断会计事项处理的顺序，有助于记账凭证与会计帐本之间的核对，确保记账凭证的完整性。
代理记账凭证的整理顺序包括：
收集整理，按顺序排列，查验日数、序号是否齐全。
按凭证汇总日期核算（如按上、中、中旬汇总归寨）明确装订的本数。
切除凭证内的内部金属物（如订书钉、订书针、曲别针）。
对大的张页或配件要折叠成同记账凭证尺寸，且要避开装订线，便于阅览，保持数据详细。
梳理查验凭证序号，若有错乱要重新排序，发现缺号要查清原因。
再检查配件有无漏缺，领料单、出入库单、工资、奖金发放单是否随附齐全。
记账凭证上相关工作人员（如财务经理、审核、记账、制单员等）的印章是否齐全。
代理记账凭证在财务管理中起着至关重要的作用，确保所有交易都被准确记录，并为审计和税务审查提供必要的证据。
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